Σε αλατισμένο νερό που έχει έρθει σε σημείο βρασμού προσθέτουμε τις πένες. Ανακατεύουμε και βράζουμε 2 λεπτά λιγότερο από το χρόνο που αναγράφει στη συσκευασία.
Ψιλοκόβουμε το κρεμμύδι μας και το σοτάρουμε σε ένα τηγάνι μαζί με λίγο ελαιόλαδο.
Ψιλοκόβουμε τη μελιτζάνα και την προσθέτουμε στο κρεμμύδι. Ανακατεύουμε καλά.
Τρίβουμε τις ντομάτες στο χοντρό τρίφτη και τις προσθέτουμε στο τηγάνι. Ρίχνουμε φρεσκοτριμμένο πιπέρι, 2 πρέζες αλάτι και τα φύλλα βασιλικού ψιλοκομμένα. Προσθέτουμε τον πελτέ και ανακατεύουμε.
Προσθέτουμε τις πένες τις οποίες έχουμε σουρώσει και τα 200 γρ. από το νερό στο οποίο τις βράσαμε. Προσθέτουμε την τριμμένη φέτα και ανακατεύουμε μέχρι να γίνει μια σάλτσα.